PyMOL

Sabe aquele trabalho de química, sobre estruturas moleculares, no qual você usou bolinhas de isopor para fazer? Bom, agora você pode usar o computador para construir estruturas moleculares tridimensionais e impressionar seu professor e colegas.

PyMOL é um ótimo aplicativo desenvolvido com o intuito de facilitar a vida de estudantes e professores das áreas de química e biologia. Com ele é possível criar qualquer tipo de estrutura molecular em 3D, ideal para prender a atenção de alunos e tornar o assunto muito mais interessante.

Imagens detalhadas

A qualidade das imagens exibidas pelo PyMOL impressiona muito os usuários pela beleza e riqueza de detalhes, além de ser totalmente personalizável. Você pode alterar as cores de cada átomo separadamente, bem como decidir se deseja ou não exibir o nome das cadeias.

Animações e efeitos

PyMOL possui uma grande quantidade de efeitos que podem ser aplicados nas estruturas, a fim de criar efeitos espetaculares e o mais próximo do real. Além disso, é possível criar vídeos com os mais diversos tipos de animações. Acessando o menu “Wizard”, na opção “Demo” é possível encontrar diversos exemplos efeitos e animações.

Interface e uso

Apesar de trazer uma interface simples, PyMOL não é muito fácil de usar. É preciso, além de conhecimentos científicos, um bom domínio do inglês e muita paciência para aprender a utilizar todas as vantagens e ferramentas do programa.

Ao executar o programa, duas janelas serão abertas: “PyMOL Viewer” e “The PyMOL Molecular Graphics System”. A primeira janela é onde as estruturas criadas serão exibidas. É nela também que as configurações de cores e efeitos poderão ser alteradas.

A segunda janela, por sua vez, contém todas as demais configurações e opções do programa. No menu “Build” é possível encontrar as opções “Fragment” e “Residue”, as quais contém os átomos e demais estruturas que podem ser utilizado para criar as cadeias moleculares.